По мейнстримной реконструкции ударение в уральском праязыке падало на первый слог, а побочное на каждый последующий нечётный слог, если он не являлся последним. Такое положение сохранилось в нганасанском, мансийском, саамских и прибалтийско-финских языках. В других языках акцентуация изменилась порой самым неожиданным образом.
Можно отдельно обсудить систему ударения в каждом конкретном. Весьма своеобразна она в пермских языках, причём несмотря на их близость, акцентуация разная в удмуртском, коми-зырянском, коми-пермяцком и коми-язьвинском.