Вообще, какова уставная задача ФИФА, кроме организации мирового чемпионата? Иначе говоря, "подчиняются" ли ей региональные и национальные организации,?
Вообще, ФИФА непосредственно проводит не только чемпионат мира. Она также проводит и некоторые другие турниры, в частности, клубный чемпионат мира, чемпионат мира среди женщин, Кубок арабских наций, молодежные и юношеские чемпионаты мира и др. Кроме того, ФИФА проводит мировые первенства по мини-футболу и пляжному футболу.
Что касается остального, то континентальные конфедерации подчиняются ФИФА, да. Там весьма жесткая вертикаль. Они входят в состав ФИФА и подчиняются ей, национальные ассоциации входят в континентальные и подчиняются им, а через них - ФИФА. Абсолютно все турниры проводятся под эгидой ФИФА, просто она делегирует права на проведение многих из них континентальным федерациям, а те многое делегируют национальным ассоциациям, которые, в свою очередь, могут делегировать эти права национальным лигам. Однако восходят все эти права к ФИФА и должны проводиться как в рамках правил футбола, утвержденных ФИФА, так и в рамках ее устава. Таким образом, ФИФА может принять некое итоговое решение, если посчитает нужным, а дальше его уже можно оспорить сначала апелляцией в соответствующие органы самой организации, если не получилось - в Спортивном арбитражном суде.
Существуют ассоциации, непризнанные ФИФА, и турниры, проходящие не под ее эгидой, но все они очень малопопулярны и слабо развиты. Пока что (и так уже около стал лет или, может, немного поменьше) без ФИФА никто не может организовать стабильно популярный, коммерчески привлекательный турнир. Если когда-нибудь такое произойдет, это будет очень серьезный переворот в футболе, а на данный момент ФИФА твердо держит всё под своим контролем.