Нацисты такие нацисты... Ну а вообще многонациональность вроде как считалась нормальной для империй. В РИ великороссы тоже не были большинством.
РИ не была тщательно спланированным государством, её многонациональность сложилась стихийно и ещё в то время, когда понятие "нация" не существовало. Потому имели то, что имели. А Японская империя - это очень поздний продукт, 20 век, и результат вполне целенаправленной политики и осмысленных решений: ср. например японскую попытку ассимилировать корейцев и абсолютное равнодушие властей РИ (кроме попытки русифицировать поляков, но там скорее цель была не прирасти "новыми русскими", а скорее избавится от назойливого нацменьшинства, которое регулярно устраивало восстания).
Однако, тем не менее, в Манчжурии не было внятной нацполитики, кроме зазывания японских крестьян колонизировать. Но даже если верить патриотическим японским данным, их даже 900 тыс туда не переехало, что было каплей в 40 миллионном китайском море. Честно, не вижу логики.
И насчёт "нацистов" - я бы не разбрасывался этикетками, а то они смысл теряют. Время становления Японской империи не имеет ничего общего с нацистской идеологией. Скорее реваншизм, и попытка урвать свой кусок, на фоне того, как практически весь мир уже был поделён между Англией и Францией. После падения Шогуната и восстановления императорской власти Мейдзи японцы быстро поняли в какой заднице они оказались из-за своей политики изоляции, и как самые лакомые куски уже были поделены, поэтому они интенсивно пытались наверстать и хапали всё, что плохо лежало, типа Сахалина или Манчжурии. По воспоминаниям современников, там скорее было лечение национальных комплексов ("мы не хуже западенцев"), чем пропаганда расового превосходства. Особенно их обрадовала победа в 1905 году, так как Россию они однозначно воспринимали как "Запад".