Саамская версия сомнительна прежде всего тем, что в самих саамских языках это слово употребляется только в фольклоре и не этимологизируется на саамском м-ле. Кроме того у юго-восточных саамов, с которыми могли контактировать новгородцы распространена форма čutte.
Поэтому наиболее приемлемо предположение о заимствовании из германского источника, в частности из готского (и «чудь», и «чужой»; во втором был суффикс -i̯o-). А перенос названия с одного народа на другой – дело обычное. Эстами в 9 в. называли балтское племя, жившее в районе современного Гданьска