Ни разу не слышал, чтобы кто-то произносил эти слова как "бытиё" и "житиё". До того, как я их в первый раз услышал, я их, конечно, так и воспринимал, но это довольно просто объясняется аналогией со всей остальной системой, где флексия <-э> в именительном падеже просто не существует как класс.