Я не согласен с такой постановкой вопроса, как будто всё только упирается в идеологию.
Тогда объясните, почему название города Таллинн в советское время писалось с одной буквой «н», в 90-е годы прошлого века с двумя (эстонцы по-русски так до сих пор пишут), а с приходом Путина к власти снова с одной?
Есть ещё удобство и привычка. Ну не хочу я писать Кыргызстан, мне не нравится такое написание.
Привычки меняются как и сам язык. Для моего сына как и его многих сверстников уже странно звучит «на Украине», так они не говорят. В англоязычных статьях уже практически не увидишь Peking, только Beijing.
А писать «Молдова» глупо, учитывая что есть Молдова в Румынии - зачем создавать двусмысленность и неразбериху?
Сами молдоване называют свою страну Moldova, собственно Молдавия и Молдова — это одно и то же, граница между ними только историко-политическая.