Теоретически может быть из какого-нибудь «параиранского» языка. В самод. *kota нет, к тому же при переходе от уральской к ФУ эпохе произошла смена типа жилища: от чума к вкопанному срубу.
А вокализм как объясняется? Ир. *kata- от *k(h)nto-, ср. ПФУ *śata "сто". К тому же слово эксклюзивно иранское, а в ПФУ обычно индоиранизмы, причем чаще такие, которые сохранились в индийских (что впрочем может объясняться объемом выборки, т.к. объем древнеиндийских источников больше, чем древнеиранских).