На мой слух в gerai он произносит краткий звук между [ɛ] и [æ],а в geras чётко долгий [æː].
вы всё правильно слышите. в geraĩ <e> безударная и поэтому краткая (именно в этом фонологическое отличие e//ę), а в gẽras - удлинение под ударением в открытом слоге. Второе - [æː], первое зависит от человека, региона, и именно вариация между [ɛ] и [æ].
не понял комента Пюфона выше насчет <r> - что не видно палатализации? Так её и
не должно быть. Палатализацию вызывают только <е>, <i> и их производные: ę, ė, į, y. Всё